技術文章
TECHNICAL ARTICLES目前已經獲批的10余款甲基化檢測產品基本都是使用熒光PCR進行檢測,采用數字PCR的這是第一款,從數字PCR的高靈敏的優勢來看,這也意味著其檢測的樣本類型會更加的普適、易獲得。
從公開信息得知,這款產品的預期用途為:用于體外定性檢測人血清中游離DNA(cfDNA)中的BMPR1A和PLAC8基因甲基化水平。
肝癌篩查方法
目前肝癌篩查方式主要包括血液學AFP(甲胎蛋白)檢測和影像學檢查。從目前診療路徑來看,肝癌早篩通常聯合AFP和肝臟超聲(US)對肝癌高危人群進行定期篩查,發現異常再進一步考慮CT或者核磁共振檢查。
· 甲胎蛋白(AFP)是目前診斷肝癌應用最多的血清學標志物,但仍有近40%肝癌患者AFP持續在正常或較低水平,而且妊娠、活動性肝炎、生殖系統腫瘤、胃腸胰腺等其他消化道腫瘤等人群血清AFP也會升高。
· 雖然超聲(US)設備簡單,價格低容易開展,在臨床上廣泛應用,但其對早期肝癌診斷靈敏度僅47%,且受肝硬化結節干擾,對操作者經驗要求較高。即使聯合應用AFP和超聲檢測,對早期肝癌的靈敏度也僅有63%,仍然無法滿足早期肝癌篩查的需求。
· CT平掃對于極早期肝癌(<1 cm)或密度近似正常肝實質的肝癌難以顯示,且具有一定的放射性。
· MRI雖然性能較超聲(US)和CT較大提升,但檢測的靈敏度和特異性也存在一定的天花板。我國人口基數大、經濟水平不足,將其作為常規篩查手段也不大現實。
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指南共識
當前,我國已有多部指南/共識將基因甲基化推薦用于肝癌早期篩查和診斷。其中,國家癌癥中心赫捷院士和陳萬青教授最新發表的《中國人群肝癌篩查指南(2022,北京)》認為,體循環中新型標志物的液體活檢手段與血清AFP比較也體現出更高的靈敏度和特異度,包括微小核糖核酸和循環腫瘤DNA等。這些證明有良好篩查價值的血清或ctDNA可作為補充篩查技術,但尚不能完替代血清AFP檢測。2021年由王紅陽院士牽頭撰寫的《中國肝癌早篩策略專家共識》明確指出cfDNA表觀遺傳性修飾檢測有一定的應用潛力,可以作為個體化診斷的補充。同年,由中華醫學會肝病學分會發布的《原發性肝癌二級預防共識》中提到,有多種處于探索階段的新型血清學分子標志物,其中包括循環腫瘤DNA甲基化等,在診斷肝細胞癌上有其特定的優勢。
數字PCR+甲基化
DNA甲基化的改變多發生于癌癥早期,在某些特定癌癥中,檢測特異的甲基化標志物有助于癌癥的早期發現,進而大大提高癌癥患者的生存率。
微液滴數字PCR (ddPCR)是近年來PCR技術的一項新進展,通過微液滴化,終點PCR和泊松分布,數字PCR無需標準曲線即可實現核酸濃度的絕對定量。與實時定量PCR技術(qPCR)對比,數字PCR具有靈敏度高,準確度高、精密度高、重復性高,對PCR抑制劑耐受度高的優勢。
使用ddPCR方法進行DNA甲基化分析時,其優勢能夠得到進一步的發揮,在檢測血漿游離DNA、FFPE DNA等多種樣本來源的DNA的甲基化狀態時表現優異。因此,基于ddPCR的甲基化檢測技術將來有潛力應用于腫瘤甲基化標志物的檢測中,輔助臨床診斷和治療,應用于腫瘤早診和篩查領域。
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